凝膠制備液相色譜儀通常都被認為和大容量色譜柱和高流速有關聯的。然而并不是以設備的大小和系統消耗的流動相的多少來決定制備高效液相色譜，而是依據分離目的來決定。分析液相的目的是給一種組份進行定量和定性。制備液相的目的是對產品的單體進行提取和純化。與傳統的純化方法（如蒸餾、萃取）比較，制備液相是一種更有效的分離方法，因此被廣泛應用在樣品和產品的提取和純化上。隨著合成、植化、生化和制藥等領域對高純度組份的需求不斷增加，制備型液相色譜儀應用的領域也在迅速的擴大發展。